草むらの近くで昼寝をしていたのび太は、首の周りにかざりのようなものがついているカエル…エリマキガエルを見つける。おどろいたのび太は、しずかやジャイアンたちにそのことを話すが、だれも信じてくれず、笑われてしまう。

すると、通りかかったおじいさんから「その話をくわしく聞きたい」と言われ、おじいさんの家に行くことに。世界中のめずらしい動物のはくせいを集めているというおじいさんの家には、いろいろな動物のはくせいがかざってあった。そんなおじいさんから、エリマキガエルをつかまえてくれたら、100万円をあげると言われるのび太たち。

のび太からその話を聞いたドラえもんは、のび太が見たのは絶滅寸前の動物かもしれないから、だれかが見つける前に安全なところにうつそうと言い出す。『あっちこっちテレビ』を使って、みんなより先にエリマキガエルをさがすことにした二人は、まるで人形のような小さな少年が草むらの中でたおれているのを見つける。

『お医者さんカバン』でその少年の手当てをし、しずかからドールハウスをかりるのび太たち。ところが、目をさました少年は、のび太たちを見てこわがってしまう。そこで、のび太たちも『スモールライト』で小さくなって話をしてみることに。

ホイと名乗るその少年は、森の中にある“ドンジャラ村”でくらす“小人族”だとわかるが…！？
（「ドンジャラ村のホイ」てんとう虫コミックス第35巻より）